Применяющий УСН с объектом налогообложения «доходы» налогоплательщик, у которого есть наемные работники, может уменьшать не более чем на 50 процентов сумму налога, в том числе на выплаченные пособия по временной нетрудоспособности, не уменьшая при этом размер пособия на величину исчисленного с него НДФЛ

Согласно п. 5 ст. 346.11 Налогового кодекса Российской Федерации (далее — Кодекс) организации и индивидуальные предприниматели, применяющие упрощенную систему налогообложения, не освобождаются от исполнения обязанностей налоговых агентов, предусмотренных Кодексом. В целях гл. 23 «Налог на доходы физических лиц» Кодекса налоговыми агентами признаются российские организации, являющиеся источником выплаты доходов, которые обязаны исчислить, удержать у налогоплательщика и уплатить сумму налога на доходы физических лиц, исчисленную в соответствии со ст. 224 Кодекса, в бюджет (п. п. 1 и 2 ст. 226 Кодекса).
В соответствии с пп. 2 п. 3.1 ст. 346.21 Кодекса налогоплательщики, перешедшие на применение упрощенной системы налогообложения и выбравшие в качестве объекта налогообложения доходы, имеют право уменьшить сумму налога (авансовых платежей по налогу), исчисленную за налоговый (отчетный) период, на сумму расходов по выплате в соответствии с законодательством Российской Федерации пособия по временной нетрудоспособности (за исключением несчастных случаев на производстве и профессиональных заболеваний) за дни временной нетрудоспособности работника, которые оплачиваются за счет средств работодателя и число которых установлено Федеральным законом от 29.12.2006 N 255-ФЗ «Об обязательном социальном страховании на случай временной нетрудоспособности и в связи с материнством», в части, не покрытой страховыми выплатами, произведенными работникам страховыми организациями, имеющими лицензии, выданные в соответствии с законодательством Российской Федерации, на осуществление соответствующего вида деятельности, по договорам с работодателями в пользу работников на случай их временной нетрудоспособности (за исключением несчастных случаев на производстве и профессиональных заболеваний) за дни временной нетрудоспособности, которые оплачиваются за счет средств работодателя и число которых установлено Федеральным законом от 29.12.2006 N 255-ФЗ.
При этом сумма налога (авансовых платежей по налогу) не может быть уменьшена на сумму указанных расходов более чем на 50 процентов.
Уменьшение суммы налога на сумму выплаченных пособий по временной нетрудоспособности производится без уменьшения суммы пособия на сумму исчисленного с нее налога на доходы с физических лиц.

�?сточник: Письмо Минфина России от 11 апреля 2013 г. N 03-11-06/2/12039